Biología de Sistemas Integrativa, Metabolómica y Cáncer 

Departamento de Bioquímica y Biomedicina Molecular

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Grupo de investigación consolidado de la Generalitat de Catalunya (2014SGR1017) desde el año 1997. Forma parte del Instituto de Biomedicina de la Universitat de Barcelona (IBUB) y de la Red de Referencia de I+D+i en Química Teórica y Computacional (XRQTC) de Catalunya.

 

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Doctorado en metabolismo del cáncer

Se buscan candidatos para solicitar becas estatales y regionales para las convocatorias (FPU, FI, APIF…) para la realización de la tesis doctoral bajo la dirección de la profesora Marta Cascante (Departamento de Bioquímica y Biomedicina Molecular, Facultad de Biología, UB).

Nuestro grupo cuenta con un excelente ambiente de trabajo y participa en distintos proyectos europeos y nacionales. También colaboramos con distintos laboratorios en la Unión Europea y Estados Unidos, ofreciendo a nuestros miembros la posibilidad de realizar estancias y parte de su proyecto en el extranjero.

El proyecto a realizar se centrará en el estudio de las alteraciones metabólicas asociadas a la resistencia a quimioterapéuticos en cáncer de próstata y colon. En nuestro laboratorio se integran distintas ómicas (metabolómica, transcriptómica, flujómica), utilizando técnicas biología celular y molecular (cultivos celulares, RNA-Seq, Western Blot, PCR, citometria de flujo…) y técnicas bioanalíticas (GC-MS, LC-MS/MS, HPLC…). Los datos obtenidos se usarán para la confección de modelos metabólicos a escala genómica (GSMM) mediante técnicas computacionales.

El proyecto de beca a solicitar puede ser para un trabajo experimental o computacional. Los candidatos deben poseer el título de Grado en Bioquímica, Química, Biotecnología, Biomedicina, Biología o disciplinas relacionadas y estar en posesión de un título de máster antes de noviembre de 2018.

Aquellos interesados pueden mandar su CV y expediente académico por correo electrónico a la Prof. Marta Cascante y la Dra. Silvia Marín.

 

 

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Sobre nosotros

En nuestro grupo llevamos a cabo una investigación interdisciplinar, combinando técnicas propias de la bioquímica, la biología celular y molecular y la bioinformática para el análisis integrado de sistemas biológicos. Nuestras líneas de investigación principales son las siguientes:

Metabolómica y fluxómica

  • Medida de metabolitos por GC/MS y LC/MS en muestras de interés biomédico, biotecnológico o industrial.
  • Análisis, en distintos metabolitos, de la distribución isotopomérica resultante de la incubación con sustratos marcados con 13C.
  • Desarrollo y aplicación de software para cuantificación de flujos metabólicos utilizando información a nivel metabolómico y cinético.
  • Caracterización de les adaptaciones metabólicas que acompañan procesos como:
      • la diferenciación celular
      • la muerte celular
      • la tumorogénesis
      • la transformación por oncogenes
      • el tratamiento con fármacos

Terapia del cáncer    

  • Estudio de las diferencias en la regulación del metabolismo energético de líneas celulares tumorales con respecto a líneas no tumorales.
  • Diseño de terapias antitumorales basadas en la inhibición de diferentes puntos clave del metabolismo de la célula cancerosa.
  • Estudio de las propiedades antitumorales y antioxidantes de polifenoles bioactivos extraídos a partir de subproductos de la industria agroalimentaria y forestal.
  • Caracterización del efecto de nuevos compuestos químicos con potencial antitumoral.

Análisis del control y la regulación de sistemas bioquímicos con finalidad biomédica o biotecnológica

  • Modelaje de las rutas metabólicas y predicción de los resultados de la manipulación de la vía por ingeniería genética con finalidad industrial o terapéutica.
  • Desarrollo de software en el entorno Mathematica(R) para el análisis y modelado de vías metabólicas.
  • Análisis del diseño y optimización de las señales de regulación de las vías metabólicas.
  • Desarrollo teórico y aplicación experimental del Metabolic Control Analysis (MCA) y de la Biochemical Systems Theory (BST).
  • Modelización de sistemas bioquímicos utilizando métodos cinéticos o estocásticos.
  • Estudio del papel de las interacciones enzima-enzima y de las uniones biopolímeros-enzimas.

 

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